Junior Bioinformatician en alternance

Vous souhaitez faire partie d'un environnement international, dynamique et passionnant ayant un impact direct sur la vie des patients atteints de cancer et de maladies rares dans le monde entier ? Mettez à profit vos compétences techniques et organisationnelles pour nous aider à remplir notre mission de démocratisation de la médecine fondée sur les données. Rejoignez notre équipe de Recherche Tertiaire en tant que Bioinformaticien Junior - Alternance (pour bénéficier d'un contrat d'apprentissage, vous devez être inscrit dans une école ou une université française). Vous devez avoir un niveau d'anglais avancé. Vous serez basé dans nos nouveaux locaux à Bidart sur la Technopole Izarbel. Pour que nous puissions traiter votre candidature, veuillez soumettre votre CV et votre lettre de motivation en anglais.Votre mission : Sous la responsabilité du chef de groupe Recherche Tertiaire et du bioinformaticien senior de l'équipe, vous deviendrez membre de l'équipe Analyse Tertiaire. L'équipe d'analyse tertiaire est chargée de soutenir la dernière étape de l'analyse des données génétiques. Les principaux objectifs de l'équipe sont (1) la recherche et l'acquisition de données et de connaissances pertinentes pour l'interprétation des variantes génétiques, (2) le développement de pipelines et de modules qui relient les données aux variantes (annotation), et (3) l'extraction d'informations à partir des données qui peuvent aider les professionnels cliniques dans l'interprétation des variantes et l'identification des variantes cliniquement pertinentes. À cette fin, l'équipe d'analyse tertiaire combine la recherche scientifique dans le domaine du cancer et de la génomique médicale avec le développement de modèles et d'algorithmes prédictifs. En tant que membre de l'équipe, vous contribuerez à l'analyse avancée des données, au développement d'algorithmes, à l'optimisation du pipeline, au soutien de la recherche, à l'assurance qualité, à la collaboration interfonctionnelle, à l'apprentissage continu, à la documentation et à l'établissement de rapports, à la résolution de problèmes et à la direction de l'équipe. Vos contributions seront déterminantes pour faire avancer la recherche génétique et stimuler l'innovation dans l'analyse tertiaire, ce qui améliorera en fin de compte les résultats pour les patients et fera progresser la médecine de précision. Vous serez impliqué dans :. Développer et soutenir les applications tertiaires pour la hiérarchisation et la classification des mutations somatiques. Les principaux objectifs et possibilités d'apprentissage seront les suivants :Participer au développement de modèles et d'algorithmes pour la hiérarchisation des variantes. Recherche dans la littérature sur la génomique du cancer pour aider à guider la conception de solutions pour l'interprétation des variantes. Concevoir et réaliser des analyses comparatives des performances des modèles statistiques et des algorithmes. Collecter et conserver des ensembles de données de référence pour l'évaluation comparative des performances des algorithmes. Documenter toutes les activités et communiquer et discuter régulièrement des développements avec l'équipe. Ce que vous apprendrez : Application des principes de la bio-informatique et de la science des données pour la recherche appliquée et la médecine de précision. Compréhension du rôle de l'analyse tertiaire dans les tests génétiques. Méthodes de pointe pour la hiérarchisation et la classification des variantes génétiques. Méthodologie de la recherche scientifique Travail au sein d'une équipe internationale et interdisciplinaire. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Would you like to be part of an international, dynamic and exciting environment with a direct impact on the lives of cancer and rare disease patients worldwide? Use your technical and organizational skills to help us fulfil our mission to democratize data-driven medicine. Join our Tertiary Research team as a Junior Bioinformatician - Alternance (to qualify for an apprenticeship contract, you must be enrolled in a French school or university). You must have an advanced level of English. You will be based at our new premises in Bidart on the Technopole Izarbel. Your mission: Reporting to the Tertiary Research group manager and senior bioinformatician in the team, you will become a member of Tertiary Analysis team. The Tertiary analysis team is responsible for supporting the last step in the analysis of genetic data. The main objectives of the team are to (1) research and acquire data and knowledge relevant for the interpretation of genetic variants, (2) develop pipelines and modules that link the data with variants (annotation), and (3) extract insights from the data that can aid clinical professionals in variant interpretation and identification of clinically relevant variants. To this end, tertiary analysis team combines scientific research in the field of cancer and medical genomics with development of predictive models and algorithms. As part of the team, you will contribute to advanced data analysis, algorithm development, pipeline optimization, research support, quality assurance, cross-functional collaboration, continuous learning, documentation and reporting, problem solving, and team leadership. Your contributions will be instrumental in advancing genetic research and driving innovation in tertiary analysis, ultimately improving patient outcomes and advancing precision medicine. You will be involved in:. Expanding and supporting tertiary applications for the prioritization and classification of somatic mutations. Key aims and learning opportunities will include:  Taking part in the development of models and algorithms for variant prioritization. Researching cancer genomics literature to help guide the design of solutions for variant interpretation. Designing and carrying-out analytical performance benchmarks of statistical models and algorithms. Collecting and curating ground-truth datasets for algorithm performance benchmarking. Documenting all activities and regularly communicating and discussing developments with the team. What you will learn : Application of bioinformatics and data science principles for the applied research and precision medicine. Understanding of the role of tertiary analysis in genetic testing State-of-the-art methods for genetic variant prioritization and classification Scientific research methodology Working within an international and interdisciplinary team Requirements- Master en biotechnologie, bioinformatique ou biomédical/génétique - Maîtrise de l'anglais - Maîtrise des langages de programmation (Python et/ou R) - Compétences en matière d'analyse et de résolution de problèmes - Excellentes aptitudes à la communication Si vous êtes proactif, curieux, collaboratif et désireux d'apprendre, rejoignez notre équipe !Cet apprentissage est disponible sur un contrat de 1 ou 2 ans.-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Master's degree in biotechnology, bioinformatics or biomedical/genetics - Fluency in English - Proficiency in programming languages (Python and/or R) - Analytical and problem-solving skills - Excellent communication skills If you're proactive, curious, collaborative and are keen to learn, then join our team!This apprenticeship is available on a 1 or 2-year contract.BenefitsVous rejoindrez une organisation où le patient est au cœur de chaque décision et de chaque action, motivée par un objectif de croissance exponentielle.Parmi les reconnaissances et les accolades de l'entreprise, citons:- Les entreprises les plus innovantes du monde (Top 10)- Les entreprises les plus intelligentes du monde (Top 50)- 100 meilleurs lieux de travail à Boston- Top 10 des startups technologiques européennes - 2020- Top 10 des startups biotechnologiques européennes à suivre - 2021- Top 25 des biotechs de la côte Est à suivre - 2021En outre, vous trouverez :- Un environnement de travail flexible, convivial et international avec une atmosphère de collaboration- Des horaires de travail flexibles, y compris un modèle de travail hybride à distance et sur site- Une mission d'entreprise passionnante qui associe la science et la technologie pour avoir un impact direct sur la vie des patients atteints d'une maladie grave.- Une entreprise à croissance rapide offrant de nombreuses possibilités de développement personnel.- Un défi technique difficile à résoudre avec une technologie moderne passionnante - cloud computing, Big Data, DevOps, apprentissage automatique.-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------You will be joining an organisation with the patient at the heart of every decision and action, driven by purpose as we drive exponential growth.Business recognition and accolades include:· World's most innovative companies (Top 10)· World's smartest companies (Top 50)· 100 Best Places to Work in Boston· Top 10 European Tech Startup - 2020· Top 10 European biotechs startup to watch - 2021· Top 25 East-Coast Biotech to watch - 2021Plus, you will find:· A flexible, friendly, and international working environment with a collaborative atmosphere· Flexible working hours, including hybrid remote / on-site working model· An exciting company mission that brings together science and technology to directly impact the lives of patients with life threatening illness· A fast-growing company with plenty of opportunity for personal growth and development· A hard technical challenge to solve with exciting modern technology - cloud computing, Big Data, DevOps, machine learning