Computational Biologist (H/F)

Notre laboratoire « Réponses inflammatoires et réseaux transcriptomiques dans les maladies » est l'une des principales équipes de recherche, impliquée dans un grand projet de recherche hospitalo-universitaire (RHU), financé par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR). Nous proposons, au sein de ce projet, de revisiter les maladies monogéniques rares, caractérisées par l'auto-immunité et/ou l'auto-inflammation, au niveau de la cellule unique. En combinant des analyses transcriptomiques, protéomiques et d'accessibilité à la chromatine réalisées sur des cellules du sang périphérique, nous visons à identifier des clusters cellulaires dits " pathologiques ", principalement enrichis en cellules de patients par rapport aux contrôles. À partir de ces groupes de cellules "pathologiques", nous avons comme objectif d'extraire de nouvelles signatures moléculaires, des biomarqueurs qui aideront à redéfinir la stratification des patients au niveau moléculaire. Nous recherchons un/une « Computational Biologist » talentueux et ambitieux, qui nous accompagnera dans ce voyage pour redéfinir l'auto-immunité et l'auto-inflammation au niveau moléculaire.

Institut Imagine

Créé à l’initiative des chercheurs et médecins de l’Hôpital Necker - Enfants malades, l’Institut hospitalo-universitaire (IHU) sur les maladies génétiques _Imagine _développe des programmes scientifiques fondés sur une continuité entre recherche fondamentale, recherche clinique et soins innovants sur les maladies génétiques et les prédispositions génétiques aux maladies fréquentes, de l’enfance à l’âge adulte. _Imagine _a pour ambition d’accélérer la recherche en l’organisant au plus près du malade afin d’apporter les solutions diagnostiques et thérapeutiques attendues par les patients et leurs familles. Notre laboratoire « Réponses inflammatoires et réseaux transcriptomiques dans les maladies » est l'une des principales équipes de recherche, impliquée dans un grand projet de recherche hospitalo-universitaire (RHU), financé par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR). Nous proposons, au sein de ce projet, de revisiter les maladies monogéniques rares, caractérisées par l'auto-immunité et/ou l'auto-inflammation, au niveau de la cellule unique. En combinant des analyses transcriptomiques, protéomiques et d'accessibilité à la chromatine réalisées sur des cellules du sang périphérique, nous visons à identifier des clusters cellulaires dits " pathologiques ", principalement enrichis en cellules de patients par rapport aux contrôles. À partir de ces groupes de cellules "pathologiques", nous avons comme objectif d'extraire de nouvelles signatures moléculaires, des biomarqueurs qui aideront à redéfinir la stratification des patients au niveau moléculaire. Nous recherchons un/une « Computational Biologist » talentueux et ambitieux, qui nous accompagnera dans ce voyage pour redéfinir l'auto-immunité et l'auto-inflammation au niveau moléculaire.

L'Institut Imagine représente un cadre unique pour développer un tel projet collaboratif basé sur des études liées à des maladies humaines, avec de nombreuses opportunités de collaboration avec des scientifiques et cliniciens nationaux et internationaux de haut niveau issus d’Imagine, de l’Institut Curie, de l’Institut Pasteur, du CEA, de l’INRA et de partenaires industriels comme Sanofi et Ariana Pharma.

MISSION ET FONCTIONS

Rattaché(e) au Directeur du laboratoire, le/la « Computational Biologist » devra mettre en place et optimiser des pipelines pour analyser des ensembles de données multi-omiques unicellulaires tels que la transcriptomique unicellulaire couplée à des anticorps à code-barres (CITE-seq), l'épigénomique unicellulaire, la transcriptomique spatiale unicellulaire,...

FORMATION

• Doctorat, diplôme d'ingénieur ou maîtrise en bio-informatique

QUALITES ET COMPETENCES CONTRAT

• Type de contrat : CDD
• Durée : 3 ans
• Date de début : Dès que possible
• Salaire : Selon expérience

MODALITE DU RECRUTEMENT

Type d'emploi : CDD